Dem barocken Truhensarkophag mit Bleilegierungen von Baptist Zacharias Lauffer verleihen Knorpelwerk, Girlanden, Löwenkopfhandhaben und reicher Zierrat große Bewegtheit im Ausdruck.

Der flache, eingelassene Deckel zeigt den kaiserlichen gekrönten Doppeladler mit viereckigem, auf die Spitze gestelltem Plastron, links davon das ungarische und böhmische Wappen, rechts davon das Wappen von Habsburg, das schwäbische, elsässische und kyburgsche Wappen, das Wappen von Pfirt und Tirol, das Wappen von Cilli und die fünf österreichischen Lerchen. Darunter befindet sich ein Christus am Kreuz und zu dessen Füßen Maria mit den sieben Schwertern. Unterhalb des Kreuzes ist die Inschriftentafel angebracht.

Die beiden Längsseiten des Sarges zieren Festons, je zwei Löwenköpfe mit Ringen als Handhabe und als Mittelstück das Monogramm ML., welches auf ornierter Kartusche von der Kaiserkrone überhöht wird. Zu den Füßen und am Kopfende befindet sich je ein Löwenkopf.

Die Inschrift lautet:

SPES MEA DOMINUS. HOC CLAUSA TUMULO MARIA LEOPOLDINA AUGUSTISSIMI CAESARIS FERDINANDI III. AUGUSTA CONJUX UNGARIAE, & BOHEMIAE REGINAE SERENISSIMORUM ARCHIDUM LEOPOLDI & CLAUDIAE SERENISSIMA FILIA.

UBI AUGUSTAM PROLEM ORBIS DELICIUM VITAE DEDIT. VITA EXCESSIT. DIGNA SAECULIS VIX IMPERII ANNUM.

SIMUL & VITAM. ET MAXIMA VIRTUTUM MERITA COMPLEVIT DIE VII. AUGUSTI: ANNO DNI MDCXLIX.

Meine Hoffnung ist der Herr. In diesem Sarg ist verschlossen Maria Leopoldina, die kaiserliche Gemahlin des allerdurchlauchtigsten Kaiser Ferdinands III., Königin von Ungarn und Böhmen, die erhabene Tochter der erhabenen Erzherzöge Leopold und Claudia. Sobald sie zur Freude der Welt einem kaiserlichen Kind das Leben geschenkt hatte, schied sie aus dem Leben. Würdig, Jahrhunderte zu leben, beschloss sie kaum ein Jahr der Regierung und das Leben zugleich am 7. August, im Jahre des Herrn 1649.

Bei der Restaurierung des Sarkophags, die im April 1988 abgeschlossen wurde, ist auch ein Innensarg aus Mahagoni angefertigt worden. Von der sterblichen Hülle der jungen Kaiserin waren neben Schädelfragmenten auch Schuhe mit einem hohen, geschweiften Absatz erkennbar.

Die silberne Herzurne zu den Füßen Leopoldinas trägt auf der Unterseite die Inschrift: "Cor Aug. mae Imperatricis Maria Leopoldinae Anno 1649 8 N N 5".

Es sind dies die Beschauzeichen einer Augsburger Arbeit der beiden Goldschmiede Hans Jakob Baur (gest. 1653) und Hans Georg Lang (gest. 1665) aus den Jahren 1635-1640.